Historien om Stargate SG-1 begynder omkring et år efter begivenhederne i spillefilmen, da USA's regering erfarer, at en gammel rumvæsenenhed kaldet Stargate kan få adgang til et netværk af sådanne enheder på et væld af planeter. SG-1 er et elite-flyvevåbens specialoperationshold, et af mere end to dusin hold fra Jorden, der udforsker galaksen og forsvarer sig mod rumvæsenstrusler såsom Goa'uld, Replikatorer og Ori.