La quinta temporada de Smallville comienza el 29 de septiembre de 2005, y termina el 11 de mayo de 2006. Consta de 22 episodios, y a partir de esta temporada la serie cambia de concepto y deja de ser una típica serie juvenil para convertirse en un show con más efectos especiales y más sorpresas con las que deslumbrar a los espectadores.