Alors que l'équipe n'a plus que 30 jours pour découvrir la taupe qui sévit en son sein, une nouvelle affaire mobilise son attention : la disparition d'une capitaine de corvette qui travaille dans une unité spéciale en collaboration avec la NSA, consacrée aux cyber-menaces. Sam fait équipe avec Anna et Callen avec Deeks. De son côté, Kensi redouble d'efforts pour retrouver sa place.