Il dottor Shaun Murphy, il dottor Morgan Reznick e la dottoressa Audrey Lim curano una donna affetta da autismo e con una delicata patologia cerebrale mentre navigano nella complicata relazione che ha con la sua compagna di stanza, anche lei nello spettro. Nel frattempo, Lea e Shaun stanno ancora cercando di capire la loro amicizia e lo status di coinquilini.